市南中学坚持依法办学，以德治校，近年来修订了《市南中学章程》，并且以学校章程为办学之基，坚持走规范化——精细化——特色化的办学之路。贯彻“以人为本”的办学理念，服务于教师和学生两大主体的全棉发展，努力办人民满意的教育，办学生喜欢的学校。

学校认真落校长负责制，发挥党组织的政治核心作用。建立健全各级各类议事机制，认真贯彻校务公开制度。依据学校章程及办学实际编撰了《上海市市南中学管理手册》，并严格按照管理的流程操作实施。学校定期召开校务会、行政会，严格执行“三重一大”决策制度，商议学校重大工作。学校定期召开教代会，切实保障教职工在教育改革和发展中享有知情权、参与权、决策权和监督权，发挥教职工的积极性、主动性，齐心协力谋发展。

不断深化学校内部管理体制改革，引入竞争激励机制，完善“校长负责制，教师聘任制，岗位责任制，教育教学目标管理”为主要内容的“三制一管理制度”。学校实行以德育、教学部门主要领导总负责制：教学分管副校长——教导处——教研组——备课组；德育分管副校长——德育室——年级组——班主任。采取“统一领导，分工合作，全程管理，各负其责”的措施，强化内部管理，逐步实现了管理制度化、规范化、科学化。

学校开展各项“法制进学校”等各项法制宣传活动，聘请校外法制辅导员，定期到学校进行法制宣传教育。

学校严格执行有关财务政策，细化项目，分类核算。本着保运转、保安全、保稳定、保发展和“量入为出、开源节流、统筹兼顾、科学合理”的原则，加强预算管理，理顺业务流程，强化基础工作，实现财务管理的规范化、科学化、民主化，为学校事业发展提供了较好的财力保障。