市南中学前身“清心学堂”创办于1860年， 1880年改为“清心书院”，1908年更名为“清心中学”，1953年由市人民政府接办，改名“市南中学”，距今有近一百五十多年的历史。

学校占地面积约17亩，建筑面积18113平方米。学校功能区域划分合理，现有两栋教学大楼；一栋实验楼；两栋辅助办公楼。初中学生教室达到标准化考试要求。学生运动区域有1440平方米室外操场及两处室内运动室。校园内绿树成荫，整洁美观，植物种类多达四十多种。古典建筑和现代化教学大楼交相辉映。

近年来，教育局加大了对现代化和信息化设备的投入。学校目前已实现了宽带接入有线和无线网络的全覆盖，为学校管理和教育教学提供了便利。除了每个教室的多媒体设备全部到位外，还配备了理化生数字实验室和多功能录播教室，计算机房也完成了改造，为教育现代化水平的整体提高助力。

学校场所设施管理制度完善，有活动方案和管理措施，专用教室、图书馆等场所设施符合有关规定，场所使用合理。有广播台、校刊、宣传栏等载体，用语用字规范，管理有序，运行良好。网络管理制度健全，监管措施有效，有专兼职的管理人员、有经费保障。

学校环境是一种无声的教育，近年来学校进行了宣传栏的改造和墙面文化的改造，使环境渲染既能反映学校的历史和办学现状，又能符合学生的年龄特点，吸引学生的注意。